その辺に関しては特に参考にしたサイトはないですねー。

俺の場合はUt VideoのYUVで圧縮してます。
コーデックの設定も特に弄ってません。そのままです。
　コーデック → 或るプログラマの一生

何となく中間ファイルは未圧縮じゃないと嫌なんで、それとは別に未圧縮の分も出してます。
で、作業は圧縮したファイルでやって、最後の最後で未圧縮のに入れ替えてます。
最初から未圧縮だと半端なく重いんですよね。
普通にやるより容量は食いますが、俺のは他の人みたいな派手なことはやらないんで、2分のPVで精々4,50Gぐらいで済みますし。

以上が基本ですね。
後は時と場合によって、HuffyuvとFastCodecを使い分けてます。
Fastの方はほとんど使いませんけど。
H.264もffdshowも特に使ってませんね。

こんな感じで大丈夫ですかね。
「俺が聞きたいのはそんなことじゃねーよ！」とかだったら、またコメントなり拍手なり下さい。

最後になりましたけど、はじめまして。